Latar belakang dari penelitian ini adalah: (1) implementasi sistem dan kebijakan mutasi yang kurang ideal; (2) tingkat absensi pegawai yang cukup tinggi; dan (3) lndikator kinerja organisasi yang belum sepenuhnya tercapai. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui: (1) mutasi pada BPK Perwakilan Provinsi Maluku Utara; (2) motivasi kerja pada BPK Perwakilan Provinsi Maluku Utara; (3) kinerja pada BPK Perwakilan Provinsi Maluku Utara; (4) pengaruh mutasi terhadap kinerja pegawai BPK Perwakilan Provinsi Maluku Utara; (5) pengaruh motivasi kerja terhadap kinerja pegawai BPK Perwakilan Provinsi Maluku Utara (6) pengaruh mutasi dan motivasi kerja terhadap kinerja pegawai BPK Perwakilan Provinsi Maluku Utara. Permasalahan yang melatarbelakangi penelitian ini adalah belum tercapainya keseluruhan indikator kinerja utama pada BPK Perwakilan Provinsi Maluku Utara, kebijakan mutasi yang belum konsisten, dan kedisiplinan pegawai yang menurun. Penelitian dilakukan pada aparatur sipil negara di lingkungan BPK Perwakilan Provinsi Maluku Utara. Penelitian ini menggunakan pendekatan kuantitatif dengan sifat penelitian asosiatif deskriptif. Prosedur pengumpulan data dilaksanakan melalui kuesioner sebagai sumber data utama, dan dilengkapi dengan wawancara/observasi dan analisis dokumen. Sampel penelitian berjumlah 49 orang dan jumlah populasi adalah 67 orang. Teknik analisis data yang digunakan dalam penelitian ini adalah analisis jalur (path analysis). Hasil dari penelitian ini menunjukkan bahwa: (1) persepsi mutasi pada BPK Perwakilan Provinsi Maluku Utara sedang; (2) motivasi kerja pegawai pada BPK Perwakilan Provinsi Maluku Utara tinggi; (3) kinerja pada BPK Perwakilan Provinsi Maluku Utara tinggi; (4) mutasi tidak berpengaruh secara signifikan terhadap kinerja pegawai dengan nilai -t hitung > -t table (-1,642 > -2,013) signifikansi 0,107; (5) motivasi kerja berpengaruh secara signifikan terhadap kinerja pegawai dengan nilai thitung > t1able (16,554 > 2,013) signifikansi 0,000; (6) mutasi dan motivasi kerja secara simultan berpengaruh terhadap kinerja pegawai dengan nilai Fhitung > F1abel (140,178 > 3,200) signifikansi 0,000. Hasil Analisis determinasi (R square) sebesar 0,859 yang berarti bahwa variabel mutasi dan variabel motivasi secara bersama-sama memiliki sumbangan sebesar 86,9% terhadap kinerja. Simpulan dari penelitian ini adalah bahwa secara parsial mutasi tidak berpengaruh secara signifikan terhadap kinerja pegawai. Motivasi kerja berpengaruh positif dan signifikan terhadap kinerja pegawai. Mutasi dan motivasi kerja secara simultan berpengaruh terhadap kinerja pegawai.